La AECID trabaja en Honduras a través de la Oficina de Cooperación Española en Honduras adscrita a la Embajada de España en el país. A esta unidad le corresponden las funciones de identificación y seguimiento de los proyectos y programas de cooperación para el desarrollo financiados por la Agencia, así como aquellas tareas de apoyo y coordinación de todos los actores de la Cooperación Española presentes en el país. De este modo, las OCE's se configuran como órgano vital a través del cual se facilita y canaliza el contacto directo con Honduras, beneficiarios y contrapartes en terreno, no sólo de la Agencia, sino de toda la Cooperación Española.